L’OFAJ a la personnalité juridique d’une organisation internationale ainsi qu’une autonomie de gestion et d’administration. Il dispose d’un fonds franco-allemand alimenté chaque année à parts égales par les deux gouvernements. Ces fonds sont utilisés dans le cadre de programmes opérationnels, conformément aux objectifs et aux Directives fixés par le Conseil d’administration. Celui-ci est secondé par un Conseil d’orientation qui élabore des avis et des recommandations concernant les objectifs et les programmes de l’OFAJ.
L’OFAJ a pour mission de promouvoir les échanges entre les jeunes des deux pays au sein d’une Europe élargie. Ce travail consiste à soutenir et à approfondir les relations entre les enfants, les adolescents et les jeunes adultes ainsi que la coopération entre les personnes actives dans le secteur de l’éducation et de la jeunesse. Dans le cadre de cet objectif, il contribue à faire découvrir la culture du pays partenaire, encourage les apprentissages interculturels, soutient la qualification professionnelle des jeunes ainsi que les offres de mobilité et d’échange. Il renforce les projets communs d’engagement citoyen, sensibilise à la responsabilité particulière de la France et de l’Allemagne en Europe et incite les jeunes à apprendre la langue du pays partenaire.